יונה טוען שה' אמור להנהיג את עולמו במידת הדין. תשובת ה' ליונה במעשה הקיקיון מלמדת את יונה ואת הקורא שה' הוא "אבינו מלכנו" ולא רק "מלכנו", שהעולם מונהג ע"י ה' גם במידת הרחמים והאהבה, כאהבת אב לבניו. בנוסף לכך, יונה לומד שהוא איננו השופט של א-לקים.