הציווי על מזבח הקטורת מופיע במנותק מהציוויים על שאר כלי המקדש מכיוון שהוא לא לגמרי חלק מהמקדש עצמו, אלא משמש כלי למיסוך והסתרה של הקודש. הצורך בהסתרה זו נובע מההשלכות של חשיפה ישירה אל השכינה, העלולה להוביל למוות.