משה חשב שהבעיה העקרית היא העבודה הזרה, הפגיעה הרוחנית, אך פעולתו לא הועילה לעצירת הנגף. פנחס הבין שמוקד הבעיה הוא הזנות, המהווה פגיעה לאומית. לכן מעשה פנחס הצליח לעצור את המגפה. הנהגתו של פנחס משלימה את הנהגתו של משה.