נחל זה שימש כגבול בין ממלכת סיחון האמורי מצפון לנחל, לממלכת מואב מדרום לנחל (במדבר כא, יג; כב לו).

לאחר ניצחון בני ישראל על סיחון מלך האמורי הפך הנחל לגבול בין שבט ראובן לממלכת מואב (שופטים יא יח, כב).

על פי מצבת מישע מלך מואב, בתקופת ממלכת בית עמרי מרדו המואבים בישראל, פלשו אל מעבר לנחל ארנון והשתלטו על אזורים מצפון לנחל. אחד הדברים בהם התגאה מלך מואב היה סלילת דרכים בארנון: "ואנכי עשיתי המסילות בארנון" (שורה 26).